Lập thành tích chào mừng Đại hội đại biểu Đảng bộ Khối cơ quan, doanh nghiệp tỉnh lần thứ VIII, Đại hội đại biểu Đảng bộ tỉnh Phú Yên lần thứ XVII và Đại hội Đảng toàn quốc lần thứ XIII; từ ngày 27 đến ngày 28/05/2020, Đảng bộ Trường Đại học Phú Yên đã tổ chức Đại hội Đảng bộ lần thứ XI, nhiệm kỳ 2020-2025.

Quy chế tuyển sinh đại học năm 2020 quy định trường đại học được phép sử dụng điểm thi được bảo lưu từ các kỳ thi THPT, THPT quốc gia những năm trước để xét tuyển.

Ngày 05/03/2020, Trường Đại học Phú Yên đã tổ chức gặp mặt chia tay ThS. Nguyễn Tiến Thành - Phó Trưởng khoa Giáo dục Tiểu học & Mầm non (với 38 năm công tác trong ngành giáo dục). Đến dự có TS.Nguyễn Định – Bí thư Đảng ủy, Phó Hiệu trưởng Phụ trách Trường Đại học Phú Yên và các đồng chí trong Ban Giám hiệu, lãnh đạo các đơn vị trong toàn trường.

Từ ngày 02/03/2020, hoạt động giáo dục và đào tạo của Trường Đại học Phú Yên đã trở lại bình thường sau hơn một tháng tạm dừng do dịch Covid -19. Ban Giám hiệu và toàn thể cán bộ, giảng viên Nhà trường đã có nhiều biện pháp phòng chống dịch tại chỗ theo khuyến cáo của các cơ quan chuyên môn.